基于原料的IVT整体解决方案
- SOLUTION -

IVT工艺开发过程中,产物高产量与高完整度,是最先被关注的基础质量指标,高产量与生产成本息息相关,高完整度是产物质量的最基础指标。

T7 RNA聚合酶作为IVT翻译中最重要的原料,对于mRNA质量有决定性作用。瀚海新酶基于酶基因资源挖掘、酶定向进化、酶人工智能设计、酶大规模制造,以及酶催化体系的应用技术研发的五大技术平台,可提供mRNA合成全套物料,还可提供多种T7 RNA聚合突变体,并且基于对不同模板,不同突变体及IVT体系的深入研究,筛选并建立了自己的IVT Buffer库,满足客户各种生产需求及应用场景。

· 案例1:基于T7 RNA聚合酶突变体(HBP000330)及buffer库,帮助客户开发IVT体系 ·
/ 提高产量及纯度 /
· 案例2:基于T7 RNA聚合酶低dsRNA突变体(HBP000340)及耐高温突变体(HBP000350),帮助客户开发IVT体系 ·
/ 减少副反应,降低终产物中dsRNA含量 /
· 案例3:基于T7 RNA聚合酶突变体(HBP000330)及buffer库,帮助客户开发IVT体系 ·
/ 进行300nt以下极短片段的生产 /
· 案例4:基于T7 RNA聚合酶突变体(HBP000330)及buffer库,帮助客户开发IVT体系 ·
/ 进行超长片段的生产,并提高纯度 /
案例5:基于T7 RNA聚合酶突变体(HBP000330)及buffer库,帮助客户开发IVT体系低温IVT提高超长片段RNA的完整度
/ 低温IVTmRNA合成 /

温度

酶量

mRNA 1(9016nt)

mRNA 2(8497nt)

mRNA 3(10255nt)

产量(μg)

完整度

产量(μg)

完整度

产量(μg)

完整度

32℃

M6

50U

63.35

76.16%

74.95

75.08%

92.7

69.55%

70U

85.8

70.67%

106.7

74.20%

108.6

70.91%

100U

108.55

72.87%

130.8

73.22%

122

63.12%

37℃

M6

70U

200.15

68.34%

219.85

71.02%

213.05

60.97%


目前瀚海新酶mRNA制剂的主要工艺环节包括mRNA的包封/装载、稀释、TFF、除菌过滤等。

RUN

TestLoadUFDF pool filter

1

包封率(%)97.6694.84
粒径(nm)67.3771.51
PDI0.090.12

2

包封率(%)
95.6995.00
粒径(nm)
66.9073.94
PDI0.130.16
LNP工艺开发服务
- PROCESS -
LNP工艺开发服务及数据数据展示
1.mRNA的包封/装载
2.稀释
3.TFF
4.除菌过滤
LNP Encapsulation
Dilution
TFF
0.22um Filtration

包封/装载工艺的基础是递送系统的设计开发。良好设计的递送系统才能使mRNA分子进入人体后避免被RNA酶降解、被有效递送至靶点、穿过细胞膜并在胞内释放。瀚海采用的是目前主流的脂质纳米颗粒的递送系统。

mRNA-LNP包封制备的关键,除了脂质成分配方外,就是工艺过程的控制了,即如何控制mRNA与脂质成分的接触和相互作用过程,以形成稳定、均一、收率高的mRNA-LNP复合物。瀚海也是采用当前主流的微流控混合技术。由于mRNA溶于偏酸性水相,脂质体溶于乙醇,通过高压使mRNA溶液与脂质体溶液形成两股射流对冲混合,强烈的湍流使各组分充分混合,同时乙醇相被稀释,溶液pH变化,脂质体析出形成脂质纳米颗粒并与mRNA形成包封复合物。

mRNA包封后需要纯化去除未包封/装载的mRNA、游离的聚合物或脂质材料,并调整最终复合物浓度、置换溶剂缓冲体系、调节pH值等,此步骤通常通过切向流过滤实现,mRNA-LNP复合物被截留,杂质及溶剂被洗滤。以4000nt mRNA为例,包封后稀释20倍,利用中空纤维柱进行切向流过滤,下图工艺数据供参考。

将firefly luciferase mRNA-LNP递送到小鼠体内,数据显示mRNA-LNP在体内高效靶向肝脏和脾脏。


下游工艺的纯化设计一般包括以下4个单元操作,可通过实施这些单元操作去除酶反应物、残留DNA和不需要的高分子量(HMW)物质等。

以4000nt mRNA为例,纯化工艺相关数据如下:

Step

Cycle No.
Load
Elution

CE (%)

SEC_HPLC(H/M/L)(%)

Res.Protein

(ug/mg)

Yield

(%)

CE 

(%)

SEC_HPLC (H/M/L)

(%)

Res.Protein (ug/mg)

dsRNA

(ug/mg)

HCD

(ug/mg) 

Res.DNAtemplate

(ug/mg) 

Endotoxin

(EU/mg)

TFF 1

Cycle 1

76

-
-
100
78.8

ND/97.3/2.8

8.5
0.69
ND

2.07×10-15

<9.4

AC

Cycle 1

71.5

ND/97.9/2.1

6.3
92.1
82.5

3.7/95.1/1.2

0.2
0.60
ND

1.04×10-15

<17.5

Cycle 2
76.7

ND/96.9/3.1

6.3
94.0
83.0
0.8/98.0/1.2
0.2
0.94
ND

9.36×10-16

<17.2

TFF 2

Cycle 1

82.8
3.6/95.4/0.9
0.2
99.6
82.5

ND/99.6/0.4

/
0.68
/
/

<6.8

纯化工艺开发
- PURIFYIN -
瀚海新酶mRNA下游工艺的一般纯化流程及作用
1.第一步UF/DF过滤
2.oligo dT填料捕获mRNA
3.UF/DF过滤进行浓缩换液
4.除菌过滤

瀚海新酶mRNA下游工艺的一般纯化流程及作用

下游工艺的纯化设计一般包括以下4个单元操作,可通过实施这些单元操作去除酶反应物、残留DNA和不需要的高分子量(HMW)物质等。

· 第一步UF/DF过滤。从接收IVT反应产物开始,然后UF/DF过滤器进行安装,用无核酸酶水冲洗,缓冲液平衡。接着将产物浓缩至目标体积,并洗滤置换到缓冲液中,最终通过对UF/DF组件进行清洗来回收产品。该操作的目的减少RNA聚合酶, DNA模板, NTPs, 加帽酶和试剂, 抑制剂等杂质, 并置换缓冲体系。

· 第二步是使用oligo dT填料捕获mRNA或者使用多模式核基球层析。前者以oligo dT(聚胸苷)配体(18-25 bp胸腺嘧啶脱氧核苷酸)和mRNA3'末端的聚腺苷酸(PolyA尾巴)通过氢键形成稳定的杂交以捕获mRNA。目的:去除缺乏PloyA尾巴的杂质如游离核苷酸、短链转录本、酶等。后者为mRNA流穿填料,将流穿和漂洗液收集为单个馏分,进入下一步骤。此步骤的目的是去除IVT反应组分污染物。

· 第三步是UF/DF过滤进行浓缩换液。将目标产物置换到最终制剂缓冲液中,并对UF/DF组件进行顶洗,以回收产物。

· 第四步也是最后一步,0.2µm除菌过滤。然后将封闭的药物底物原液灌装到无菌容器中。应该注意的是,任何不能被检测确认为无核酸酶的管路、层析或过滤部件需在环境条件下用0.5M NaOH保持至少1小时,然后用无核酸酶水和适当的缓冲液冲洗以用于下一单元操作。

最后,这些纯化过的mRNA药物底物原液可以进行下一步,即包裸到LNP中。

纯化工艺开发及数据展示

在mRNA领域,除了设计优化mRNA的序列与开发高效、安全的递送载体,开发简单、快速、大规模且兼具经济效益的mRNA制备工艺也是mRNA技术最重要的创新之一。在mRNA的生产工艺中,IVT后的纯化对于最终mRNA产品的安全性和有效性非常重要,因为杂质的含量会影响mRNA的翻译效率,并改变免疫原性。因此需要进行杂质的去除,相关杂质包括残留底物、dsRNA、异常mRNA、DNA模板、蛋白酶残留等。常用的纯化手段包括超滤、层析、沉淀等。

目前瀚海新酶可提供的mRNA下游纯化方案如下:
Linearized pDNA
IVT
Dnase I Digestion
TFF 1
AC/MMC
Polishing Step
TFF 2
Final Filtration And Dispense
Drug Substance
Proteinase K Digestion
Two-stage TFF
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